台当局行政管理机构12月26日通过了“两岸人民关系条例”修订草案，规定台湾所有公务员赴大陆都将被纳入管控，这一举措在岛内引发了强烈质疑。
修订草案对岛内公务员前往大陆改为采取“全面许可制”。现行规定中，“11级职务级别以上公务员赴陆须申请许可”，而新规定进一步要求“10级职务级别以下、未涉密的基层公务员未来赴陆必须经原单位同意，否则将依人事法规议处”。此外，台湾地区民意代表及卸任3年内的县市长赴陆也均须经过审查。
国民党民代陈玉珍批评说，民进党似乎打定主意要打仗。她认为，如果民意代表做得不好，老百姓自然会赶他们下台，而不是每天想着限制民众权益。
修订草案还禁止指标性卸任官员赴陆出席所谓妨害“台湾尊严”的活动，对象范围扩大至卸任台湾地区正副领导人、当局机关政务人员等。国民党民代赖士葆指出，这实际上是针对马英九的条款，未来再去大陆的话，他可能会受到处罚。但“损害尊严”的定义并不明确，等于给了行政部门空白授权。
国民党民代翁晓玲则表示，现在的做法是在走回头路，似乎要回到过去的“戒严时代”。
台湾方面陆委会声称，全台军公教人员约62万人，其中被列为管制人员的约2.8万人，占4%。以今年1月至10月为例，提出赴陆申请的有233人次，不予许可的有32人次。
台湾《中国时报》董事长兼发行人王丰分析称，这种管控措施会造成寒蝉效应，给人一种进入“类戒严”状态的感觉，冻结或限缩两岸关系的发展。他认为这对两岸关系的正常发展非常不利，而且公教人员也有退休的一天，不能永远绑住他们。除非民进党当局有胆子搞“戒严”，否则无法阻止全部台湾百姓赴陆。这样的做法只会让大多数台湾人民看清民进党的真面目，对民进党来说弊大于利，不会影响两岸的正常交流，反而会让台湾自己更加萎缩。