29日上午，香港特区行政长官李家超与特区政府主要官员、公务员等在政府总部举行悼念活动，哀悼大埔火灾中的遇难者。仪式于8时开始，护旗人员入场，奏唱国歌后，国旗及区旗缓缓升至顶端再降至半旗位置。全体人员默哀三分钟，现场气氛庄重肃穆，许多市民自发前来参加悼念。
来港协助救灾工作的中央港澳办、国务院港澳办分管日常工作的副主任徐启方；中央港澳办、国务院港澳办副主任，中央政府驻香港联络办主任周霁；中央港澳办、国务院港澳办副主任农融也出席了悼念活动。随后，李家超、徐启方、周霁、农融以及特区政府主要官员签署吊唁册，向遇难者致哀。
同日上午，中央政府驻香港联络办、驻港国家安全公署、外交部驻港特派员公署、解放军驻港部队等机构也举行了下半旗和默哀仪式。11月29日至12月1日，香港特区所有政府建筑物及设施的国旗及区旗下半旗志哀，特区政府主要官员取消非必要公开活动，由政府举办及资助的娱乐及庆祝活动按情况安排取消或延期。
特区政府在全港18区设置了吊唁处供市民凭吊。在大埔富亨邻里社区中心，已有市民在吊唁处签署吊唁册。火灾现场附近，也有市民献上鲜花寄托哀思。此次发生在大埔宏福苑的五级火警已造成128人遇难。