“12·3紧急戒严事件”43天后，尹锡悦被逮捕。韩国高级公职人员犯罪调查处（公调处）宣布，当地时间1月15日上午10点33分，尹锡悦被捕。这是韩国历史上首次逮捕现任总统。
尹锡悦抵达公调处，并在当天发表了预先录制好的视频讲话。他在讲话中表示，为了避免不光彩的流血事件，尽管他认为调查是非法的，但他决定先回应公调处的出席要求。然而，这并不意味着他承认公调处的调查。
同一天，在韩国政府果川办公大楼附近的停车场发生了自焚事件，导致一人死亡。公调处计划在接下来的48小时内审讯尹锡悦，之后将决定是否释放他或申请延长拘留期限。目前，尹锡悦被关押在首尔拘留所，由于其总统身份，可能会被安排在一个单独的房间内，并按照规定的作息时间生活。
尹锡悦在接受公调处讯问时拒绝回答任何问题。讯问从上午11时开始，持续了超过5个小时，期间还为尹锡悦准备了休息室和餐食。尹锡悦方面认为公调处没有内乱罪调查权，逮捕令也是非法的，因此不接受调查，并拒绝录音录像。
尹锡悦的被捕被视为韩国宪政史上的一个重要事件。此前，韩国国会在2024年12月14日通过了对尹锡悦的弹劾案。随后，代总统崔相穆在2024年12月31日任命了两名宪法法院法官。预计宪法法院将在4月18日之前给出关于弹劾案的基本判决。
对于尹锡悦被捕一事，中国外交部发言人郭嘉昆表示不对韩国内政作评论，但强调中韩关系的重要性。日本官房长官林芳正也表示密切关注此事，并强调日韩关系的重要性不变。美国白宫国家安全委员会则表示赞赏韩国根据宪法行事的努力。
此外，有报道称尹锡悦夫人金建希的博士学位可能被撤销。金建希的硕士论文已被初步判定为抄袭，如果硕士学位被撤销，她的博士学位也将受到影响。尹锡悦被捕当天，一名疑似金建希的女子在总统官邸院内遛狗。自“戒严令”风波以来，尹锡悦夫妇一直保持低调。