当地时间9月3日，美国波士顿联邦地区法官艾莉森·伯勒斯裁定特朗普政府冻结哈佛大学超过20亿美元联邦资助的行为系非法。该法官表示，特朗普政府在4月份暂停了哈佛大学一系列研究经费，没有遵循正当程序，且侵犯了哈佛大学的言论自由权。
美国白宫发言人利兹·休斯顿（Liz Huston）当天发表声明回应说，哈佛大学未能保护学生免受侵扰，并允许歧视在校园肆虐多年，哈佛大学没有宪法赋予的获得纳税人资金的权利，并且未来仍然没有资格获得资助。休斯顿表示，美国政府将对此裁决提出上诉。
今年4月，特朗普政府以哈佛大学未充分解决校园反犹太主义问题为由，削减其逾20亿美元联邦资助。数月以来，特朗普政府和哈佛大学一直在就恢复研究经费进行谈判。7月21日，美国哈佛大学诉特朗普政府非法冻结联邦资金案在波士顿联邦地区法院举行关键听证会。