6月13日，以色列对伊朗发动空袭后不久，一名以色列情报人员向一名伊朗伊斯兰革命卫队将军发出警告：“你已经被锁定，现在给你12个小时，带着你的家人离开。记住，我们比你的颈静脉还靠近你。”据知情人士透露，以色列情报人员随后展开了一场秘密恐吓行动，目的是通过恐吓伊朗高层人员，造成该国内部分裂。
以色列情报人员使用波斯语直接给伊朗高级官员打电话，警告他们如果不停止支持伊朗最高领袖哈梅内埃伊，就会面临死亡。一位知情人士估计，大约有20多人收到了这样的“警告”。一份近4分钟的通话记录显示，一位将军级别的伊朗伊斯兰革命卫队成员被警告还有12个小时可以离开，并要求他录制一段视频表明自己与伊朗政府划清界限。目前不清楚这名将军是否录制并发送了相关视频，但知情人士透露，这位将军还活着且仍在伊朗境内。
以色列情报人员在电话中提到已被杀的伊朗武装部队总参谋长穆罕默德·巴盖里、伊朗伊斯兰革命卫队总司令侯赛因·萨拉米等人，称“听清楚了，我们两个小时前已经一个一个地杀死了巴盖里、萨拉米等人”。
据此前报道，以色列情报机构摩萨德已向伊朗部分可能接替死者职务的官员发送了“死亡通知”。有的伊朗高级官员被多次警告，最终选择与以色列情报部门对话。这次秘密恐吓行动主要针对伊朗二三线高层人物，目的是让哈梅内伊难以指派人手补位。多名高级别军事指挥官在以色列的轰炸中身亡，迫使哈梅内伊紧急启动大规模人事任命。一位知情人士说，这让哈梅内伊难以顺利启用他的“第一选择”弥补空位。不过西方安全官员表示，没有看到伊朗军方或伊朗革命卫队高级官员叛逃的迹象。
与此同时，伊朗也抓获了伊朗境内数名受雇于以色列的间谍并实施处罚。