1月26日，韩国检方针对总统尹锡悦去年12月3日晚发布的“紧急戒严”行为，以“内乱罪”对其提出起诉。这是自1987年韩国民主宪政以来首次对在任总统提起刑事诉讼。此次起诉不仅意味着宪法法院已启动弹劾审理程序，还表明检方可以从刑事责任的角度展开调查。据报道，即使尹锡悦拒绝接受调查，检方也已经起诉了建议其宣布“紧急戒严”的前国防部长金龙显等人，因此在取证方面不存在问题。
公调厅在本月23日的记者会上表示，检察机关进行追加调查将有助于查明事件真相，并将案件移交给检方。随后，检方要求将尹锡悦的拘留期限延长至2月6日，但首尔中央地方法院以没有充分理由为由驳回了这一申请。尽管检方再次提出申请，仍被法院驳回。
为了应对法院不批准延长拘留的情况，韩国检察机关事先拟定了起诉状，并于26日召开了全国检察长紧急会议。会后决定起诉尹锡悦。尹锡悦的律师团队对此批评称，检方的起诉将成为韩国检察机关历史上无法抹去的耻辱，并强调尹锡悦宣布戒严令绝不可能构成内乱罪，希望通过审理查明公调处和检方调查的违法性。
围绕尹锡悦被起诉一事，韩国国内左右阵营及法律界存在争议。一方认为起诉总统是滥用权力的行为，在法治国家中不应允许；另一方则认为尹锡悦发布紧急戒严令破坏了韩国基于法治的民主架构，给民众带来痛苦，应受到惩罚。