为提升市民公交出行体验，南京市计划新辟调整30条公交线路，重点关注保障房片区、新建城市小区、城郊接合部、地铁衔接点、街道支巷以及过江线路等区域。同时，将升级改造30处公交站点，以进一步完善公交系统。
公交站台是公交服务的重要组成部分，南京市交通运输局将继续与属地政府、公安交管等部门合作，按照统一规划、分步实施的原则，结合新开通的城市轨道线路及市民建议，推进南京公交站台的提档升级工作。
农村公路的质量直接影响到镇村公交、校车及城乡客运班车的安全运营，也关系到农村经济的发展和农业产业的发展。作为交通行业主管部门，南京市交通运输局将指导各区编制项目计划，争取省市两级补助资金，确保建设质量，有序推进项目建设，为农村居民提供安全快捷的出行条件，并促进农业产业快速发展。
目前，南京主城区在建地铁线路包括4号线二期、5号线、6号线、7号线、9号线和10号线二期，以及其他大型基建项目如惠民大道综合改造工程和建宁西路过江通道工程。这些项目建成后将改善民生出行，但建设期间的道路占用围挡给市民带来不便。2025年，相关单位计划拆除20处大型基建占用，结合地铁开通时序拆除主城核心区的部分围挡，提高周边居民交通出行的便利性。
南京市交通运输局联合企业共同打造交通“宁小蜂驿站”，计划在2025年新建8个驿站，为出租汽车驾驶员提供学习教育、政策咨询、业务办理、诉求收集、停车充电、就餐饮水等服务，解决司机群体面临的各种难题，增强党在新兴领域的号召力和凝聚力。
地铁5号线于2016年12月开工，是一条南北向贯穿南京主城的重要地铁线路。经过多方努力，5号线南段于2024年3月31日开通初期运营，全年客运量达680.2万乘次。为尽早实现全线贯通投运，相关部门提前做好割接实施方案，协调多个部门，确保运营秩序平稳有序。